Уротропин применяют как антитоксическое, антимикробное и диуретическое средство при воспалении почек, мочевого пузыря и мочевыводящих путей у крупного рогатого скота и свиней. Препарат используют при интоксикациях и токсикоинфекциях с целью нейтрализации и ускорения выведения токсинов из организма.

Уротропин применяют также в комплексной терапии при лечении эндометритов и маститов с признаками интоксикации у коров. Препарат применяют внутривенно (свиньям в ушную вену) 2-3 раза в сутки в следующих дозах: крупному рогатому скоту 1,5-2 мл на 10 кг массы тела, свиньям 0,5-0,7 мл на 10 кг массы тела. Длительность применения препарата и доза зависят от характера и тяжести протекания заболевания. В мочевых путях крупного рогатого скота действие уротропина выражено слабее, из-за щелочной реакции мочи. В этом случае необходимо назначать вещества, сдвигающие реакцию мочи в кислую сторону.

Убой животных на мясо разрешается не ранее, чем через сутки после последнего применения препарата. Мясо животных, вынужденно убитых до истечения указанного срока, может быть использовано для кормления пушных зверей или производства мясокостной муки. Применение молока в пищу людям разрешается через сутки после последнего введения препарата. Молоко, полученное от коров во время лечения, используется в корм животным после кипячения.